金秀瑶族自治县地处广西中部略偏东的大瑶山主体山脉上，属南亚热带季风气候区，季节性变化很明显，具有显著的亚热带山区气候特点，阴雨天多，日照少，湿度大，夏季，湿润多雨，冬季，干冷少雨。

年平均气温17.6℃，最冷月平均气温9.2℃，最热月平均气温24.3℃，历年平均最高气温22.2℃，平均最低气温14.4℃；历史极端最高气温33.7℃，极端最低气温-5.6℃。雨量充沛，分布均匀。年平均降雨量1722.2毫米, 其中4-9月降雨量1344.5毫米，占全年降雨量的78.1%。年平均相对湿度82%，最小相对湿度8%，年平均无霜期355天，全年日照时数1119.2小时，占可照时数的25%，年平均风速1.7米/秒，最多风向为S风，年平均蒸发量1110.0毫米，年雷暴日数55天。主要气象灾害有洪涝、干旱、冰雹、寒潮等。